Thèse soutenue le 04 mai 2009 pour obtenir le grade de Docteur de l'Université Joseph Fourier de Grenoble I - Discipline : Chimie/ Biologie
Résumé :
La Quinolinate synthase (NadA) catalyse la condensation de l'iminoaspartate et de la dihydroxyacétone phosphate aboutissant à la formation d'acide quinolinique, un intermédiaire central dans la biosynthèse du nicotinamide adénine dinucléotide (NAD). Cette étude a permis de montrer que toutes les quinolinate synthases possèdent un centre [4Fe-4S] essentiel à l'activité et que seulement 3 résidus cystéines coordinent le centre métallique, les cystéines Cys113, Cys200 et Cys297 chez
E. coli. Les propriétés spectroscopiques et biochimiques du centre [4Fe-4S] nous ont conduit à proposer que le centre fer-soufre joue un rôle de type aconitase/déshydratase dans la catalyse enzymatique. Deux autres cystéines impliquées dans la formation d'un pont disulfure, sont également essentielles à l'activité quinolinate synthase (Cys291 et Cys294 chez
E. coli) en jouant probablement un rôle régulateur. Nous rapportons également une nouvelle hypothèse de mécanisme pour la formation de l'acide quinolinique, incluant l'isomérisation du glycéraldéhyde 3-phosphate en DHAP. Enfin, nous proposons NadA comme une cible potentielle d'agents antibactériens. Sur les différentes molécules testées
in vitro, l'acide phosphoglycolohydroxamique (PGH) s'est avérée actif sur la quinolinate synthase d'E. coli et de
M. tuberculosis, en agissant comme un inhibiteur compétitif du DHAP.
Jury :
Président :
Pr Franck Fieschi
Rapporteur : Pr Jean-Pierre Mahy
Rapporteur : Pr Olivier Ploux
Examinateur : Dr Bertrand Gakiere
Invité : Pr Juan-Carlos Fontecilla-Camps
Directeur de thèse : Pr Marc Fontecave
Co-directrice de thèse : Dr Sandrine Ollagnier-de-Choudens
Mots-clés :Quinolinate synthase (NadA), Nicotinamide adénine dinucléotide (NAD), Dihydroxyacétone Phosphate, Iminoaspartate, acide quinolinique, [4Fe-4S], antibactériens, Acide phosphoglycolohydroxamique (PGH)
Télécharger la thèse.